Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN2P17655 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms