Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB3P14651 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB3P14651 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms