Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMP3P12645 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMP3P12645 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms