Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms