Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NR2F1P10589 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms