Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFMP07197 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms