Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRB1P04280 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRB1P04280 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms