Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEBLO76041 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms