Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NIPSNAP2O75323 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms