Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTATSF1O43719 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms