Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRPO00591 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRPO00591 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRPO00591 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRPO00591 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRPO00591 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRPO00591 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms