Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf172C9J069 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms