Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms