Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDR42E2A6NKP2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms