Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms