Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms