Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DYNC1LI1Q9Y6G9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms