Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP20Q9Y6A4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP20Q9Y6A4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms