Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL3Q9Y4R7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL3Q9Y4R7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL3Q9Y4R7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms