Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KDM2AQ9Y2K7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KDM2AQ9Y2K7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KDM2AQ9Y2K7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms