Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VDAC3Q9Y277 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VDAC3Q9Y277 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms