Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO1Q9UQ84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO1Q9UQ84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXO1Q9UQ84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms