Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX6Q9UPM6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX6Q9UPM6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms