Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS3Q9UNS2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPS3Q9UNS2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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