Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNRF3Q9ULT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNRF3Q9ULT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNRF3Q9ULT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNRF3Q9ULT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms