Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKM9

RALY, RNA-binding protein Raly, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALYQ9UKM9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALYQ9UKM9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RALYQ9UKM9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALYQ9UKM9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms