Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CROTQ9UKG9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CROTQ9UKG9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CROTQ9UKG9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms