Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO9Q9UK97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FBXO9Q9UK97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO9Q9UK97 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms