Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF223Q9UK11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms