Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HACL1Q9UJ83 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HACL1Q9UJ83 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HACL1Q9UJ83 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HACL1Q9UJ83 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms