Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPN3Q9UHW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPN3Q9UHW5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms