Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OPN4Q9UHM6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN4Q9UHM6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OPN4Q9UHM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN4Q9UHM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.1 ms