Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMTOR3Q9UHA4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms