Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNN3Q9UGI6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNN3Q9UGI6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms