Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEF1Q9UBV8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PEF1Q9UBV8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEF1Q9UBV8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms