Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DKK4Q9UBT3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DKK4Q9UBT3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DKK4Q9UBT3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms