Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ORC3Q9UBD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ORC3Q9UBD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ORC3Q9UBD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms