Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-18Q9QC07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-18Q9QC07 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-18Q9QC07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms