Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRFN1Q9P244 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRFN1Q9P244 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRFN1Q9P244 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms