Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC88CQ9P219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms