Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSWIM5Q9P217 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZSWIM5Q9P217 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSWIM5Q9P217 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSWIM5Q9P217 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms