Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBAP1Q9NZ09 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBAP1Q9NZ09 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP1Q9NZ09 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms