Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALKBH4Q9NXW9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKBH4Q9NXW9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms