Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDL2Q9NX52 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHBDL2Q9NX52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms