Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIC8BQ9NVN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIC8BQ9NVN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms