Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC39A9Q9NUM3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC39A9Q9NUM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms