Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms