Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FARSBQ9NSD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FARSBQ9NSD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FARSBQ9NSD9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms