Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOMER3Q9NSC5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOMER3Q9NSC5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOMER3Q9NSC5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms