Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC1Q9NRX5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC1Q9NRX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC1Q9NRX5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms